پس از اجرای کامل و موفق فازهای برنامه ریزی و هزینه یابی در ستاد سازمان هواشناسی کشور و ادارات کل استانی و محاسبه بهای تمام شده فعالیت ها و خدمات این سازمان، فاز سوم و تکمیلی اجرای بودجه ریزی مبتنی بر عملکرد یعنی اجرای نظام ارزیابی عملکرد در این سازمان آغاز شده است و مراحل نهایی خود را طی میکند.